Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
GCSHP23434 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GCSHP23434 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
GCSHP23434 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
GCSHP23434 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
GCSHP23434 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
GCSHP23434 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GCSHP23434 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
GCSHP23434 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GCSHP23434 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GCSHP23434 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GCSHP23434 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GCSHP23434 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GCSHP23434 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GCSHP23434 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
GCSHP23434 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
GCSHP23434 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
GCSHP23434 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms