Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA6P23229 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms