Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAV1P15498 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAV1P15498 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAV1P15498 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms