Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRAFP15056 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BRAFP15056 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BRAFP15056 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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