Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ACTN1P12814 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms