Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODC1P11926 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODC1P11926 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODC1P11926 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODC1P11926 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODC1P11926 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODC1P11926 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ODC1P11926 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODC1P11926 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ODC1P11926 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ODC1P11926 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ODC1P11926 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms