Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRPRAP08240 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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