Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATE1O95260 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATE1O95260 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ATE1O95260 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ATE1O95260 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATE1O95260 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATE1O95260 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATE1O95260 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATE1O95260 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATE1O95260 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATE1O95260 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ATE1O95260 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATE1O95260 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ATE1O95260 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATE1O95260 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATE1O95260 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATE1O95260 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATE1O95260 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATE1O95260 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATE1O95260 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATE1O95260 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATE1O95260 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATE1O95260 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATE1O95260 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATE1O95260 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ATE1O95260 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms