Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCDH8O95206 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms