Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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