Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP9BO43861 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP9BO43861 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms