Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PHF1O43189 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PHF1O43189 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF1O43189 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PHF1O43189 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF1O43189 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PHF1O43189 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PHF1O43189 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHF1O43189 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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PHF1O43189 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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