Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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NDUFS4O43181 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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NDUFS4O43181 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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NDUFS4O43181 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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NDUFS4O43181 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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NDUFS4O43181 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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NDUFS4O43181 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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NDUFS4O43181 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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NDUFS4O43181 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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NDUFS4O43181 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
NDUFS4O43181 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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