Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGSM2O43147 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms