Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
O00370 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
O00370 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
O00370 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
O00370 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
O00370 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
O00370 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
O00370 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
O00370 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
O00370 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
O00370 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
O00370 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
O00370 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms