Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF103O00237 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF103O00237 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF103O00237 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF103O00237 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF103O00237 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF103O00237 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF103O00237 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF103O00237 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms