Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 PFKM-202ENST00000340802 3176 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VGLL3A8MV65 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 EIF3C-209ENST00000566501 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 KIF28P-202ENST00000504864 3064 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms