Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KNCNA6PVL3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms