Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NEMP2A6NFY4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms