Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
U3KPZ7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
U3KPZ7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U3KPZ7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U3KPZ7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U3KPZ7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
U3KPZ7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
U3KPZ7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 TGIF1-203ENST00000345133 1088 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 NDE1P2-201ENST00000605569 1105 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
U3KPZ7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
U3KPZ7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
U3KPZ7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
U3KPZ7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
U3KPZ7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
U3KPZ7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
U3KPZ7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
U3KPZ7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
U3KPZ7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U3KPZ7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
U3KPZ7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
U3KPZ7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
U3KPZ7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
U3KPZ7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U3KPZ7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U3KPZ7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U3KPZ7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
U3KPZ7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms