Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SNX13Q9Y5W8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms