Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM2AQ9Y2K7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms