Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ERVW-1Q9UQF0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms