Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC8A2Q9UPR5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC8A2Q9UPR5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms