Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VPS4AQ9UN37 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms