Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms