Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DKK2Q9UBU2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms