Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms