Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GDE1Q9NZC3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms