Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOMER3Q9NSC5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms