Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYLDQ9NQC7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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