Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms