Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZCCHC17Q9NP64 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZCCHC17Q9NP64 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms