Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BHLHE41Q9C0J9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms