Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CNTNAP3Q9BZ76 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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