Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PACSIN1Q9BY11 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms