Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TDRD1Q9BXT4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms