Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFHD1Q9BUP0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms