Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAGR1Q9BTK6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms