Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTKNQ9BST9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms