Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NICN1Q9BSH3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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