Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EBF4Q9BQW3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms