Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBP5Q96PP8 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms