Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SAMD8Q96LT4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SAMD8Q96LT4 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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