Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms