Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYTL4Q96C24 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms