Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SLC9A6Q92581 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms