Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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