Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LMNTD2Q8IXW0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms