Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC50Q8IVM0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms